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铅优化

以上:一系列示出优化的初始前景的铅化合物,以改善活性位点的亲合性雷切尔图像。许多潜在的优化导线进行进一步的测试产生。

基于测定的先导化合物的优化是在已经通过计算和/或发现的化合物进行 铅发现。我们利用铅优化了在大型制药公司最常使用的两个主要工具:

Rachel和查理是SYBYL程序包的两个模块。这些方法有铅化合物转化为FDA成功的跟踪记录批准的治疗药物。

RACHEL – (Real-time Automated Combinatorial 瑞秋 - ( 即时的 启发式 Heuristic E增强 组合 瑞秋 - ( 即时的 启发式 LEAD化合物) 增强 组合 瑞秋 - ( 即时的 启发式

从一个配体/受体结构开始,拉结执行通过系统地衍生于配体用户定义网站自动铅化合物的组合优化。这些化合物的活性位点内的构象搜索,评估,只有那些与受体紧密结合被保留。然后化合物的这种新的人口被处理以形成下一代衍生物。随着时间的推移,铅化合物迭代地细化成一组高亲和性的结构。

查理

查理允许用户生成支架到活性位点的范围内单独的,停靠,高亲和性结构链接成完整的化合物。查理是在建筑结构之间的桥精通并且当紧密结合的活性位点的不同区域的子结构是本是有用的。